基因調控(kong)拼(pin)圖(tu)

基因調控(kong)拼(pin)圖(tu)
來(lai)自瑞典(dian)卡羅(luo)琳(lin)斯(si)卡醫(yi)學院的研究(jiu)人(ren)員(yuan)取得了基因調控(kong)研(yan)究(jiu)的突(tu)破性(xing)進(jin)展(zhan)——他們(men)識(shi)別出(chu)了結合(he)在調(tiao)控(kong)基因表(biao)達的400多個蛋白(bai)上的DNA序(xu)列(lie)，這(zhe)將(jiang)有(you)助(zhu)於解(jie)析為(wei)什(shen)麽不(bu)同的個體，其(qi)基因組對(dui)疾(ji)病(bing)患病(bing)風險的影響不同。

2000年(nian)，科學家們(men)完(wan)成(cheng)了人(ren)類基因組測序(xu)，希(xi)望(wang)能將(jiang)這(zhe)整(zheng)個(ge)人(ren)類DNA序(xu)列(lie)信(xin)息，迅(xun)速轉換到臨(lin)床(chuang)應(ying)用上來(lai)，比如新型藥物(wu)，和能(neng)判(pan)斷(duan)有(you)患病(bing)風險的個體的預測工(gong)具(ju)。

然(ran)而(er)結果(guo)卻(que)證明這實際(ji)上(shang)比預期的更難(nan)以(yi)實現，其(qi)中的壹(yi)個原(yuan)因就在於基因組中只(zhi)有(you)％的序(xu)列(lie)用於編(bian)碼蛋白(bai)，其(qi)余(yu)的大部分(fen)都用於了調(tiao)控(kong)這(zhe)些(xie)蛋白(bai)在不(bu)同(tong)的細(xi)胞(bao)和(he)組(zu)織(zhi)中如何表(biao)達。而(er)科(ke)學家們(men)又(you)不(bu)清(qing)楚哪些(xie)DNA序(xu)列(lie)能(neng)結合(he)壹(yi)些特(te)異性(xing)蛋(dan)白(bai)，也就是轉錄(lu)因子，調(tiao)控(kong)基因表(biao)達，因此阻(zu)擋(dang)了臨(lin)床(chuang)應用前進的步伐(fa)。

“基因組就像(xiang)是壹(yi)本用外文撰寫(xie)的書(shu)，我們(men)知道每個字母，卻(que)不理(li)解(jie)為(wei)什(shen)麽人(ren)類基因組造(zao)就(jiu)出(chu)的是人(ren)，而(er)小(xiao)鼠(shu)基因組生成(cheng)的是小(xiao)鼠(shu)，”領導這壹(yi)研究(jiu)的Jussi Taipale教授表(biao)示，“為(wei)什(shen)麽某(mou)些人(ren)患上(shang)常(chang)見(jian)疾(ji)病(bing)的風險更(geng)高，比如心臟(zang)病(bing)或癌(ai)癥，也壹(yi)直是壹(yi)個迷(mi)。”

人(ren)類基因組編碼約000個(ge)轉(zhuan)錄因子，這(zhe)些(xie)作(zuo)用因子能(neng)特(te)異性(xing)結合(he)短序(xu)列(lie)DNA上(shang)，調(tiao)控(kong)其(qi)它蛋(dan)白(bai)的表(biao)達。在這(zhe)篇(pian)文章(zhang)中，研(yan)究(jiu)人(ren)員(yuan)發(fa)現(xian)了結合(he)在超(chao)過400個(ge)這樣(yang)蛋白(bai)上的DNA序(xu)列(lie)，這(zhe)些(xie)轉錄因子占(zhan)據(ju)了所有(you)人(ren)類轉(zhuan)錄因子大(da)約(yue)壹(yi)半的份額(e)。研究(jiu)人(ren)員(yuan)采(cai)用了壹(yi)種新方(fang)法(fa)生(sheng)成數據，這(zhe)種(zhong)方(fang)法(fa)通(tong)過(guo)新型DNA測序(xu)儀(yi)，生(sheng)成了數以百(bai)萬的序(xu)列(lie)，其(qi)結果(guo)也非常(chang)和(he)可靠(kao)。

此外(wai)，研(yan)究(jiu)人(ren)員(yuan)還(hai)將(jiang)人(ren)類轉(zhuan)錄因子的結合(he)特(te)異性(xing)，與(yu)小(xiao)鼠(shu)轉(zhuan)錄因子結合(he)特(te)點(dian)進(jin)行了比對(dui)，結果(guo)令(ling)研究(jiu)人(ren)員(yuan)感(gan)到驚(jing)訝(ya)的是，沒有(you)發現(xian)任何(he)差(cha)別。

研(yan)究(jiu)人(ren)員(yuan)認(ren)為(wei)，這(zhe)些(xie)結果(guo)表(biao)明人(ren)類和(he)小(xiao)鼠(shu)的基因表(biao)達基本機(ji)器(qi)十分(fen)相似(si)，轉(zhuan)錄(lu)因子的差(cha)別並(bing)不(bu)會引起其(qi)大小(xiao)和(he)形狀(zhuang)上的變化(hua)，而(er)是由(you)這(zhe)些(xie)結合(he)其(qi)上的特(te)異性(xing)序(xu)列(lie)的存(cun)在或(huo)缺(que)失，造(zao)成(cheng)差(cha)別。

“總的來(lai)說，這項(xiang)研(yan)究(jiu)取得了基因表(biao)達調(tiao)控(kong)研(yan)究(jiu)的突(tu)破性(xing)進(jin)展(zhan)，朝著解(jie)碼基因表(biao)達密(mi)碼邁進(jin)了壹(yi)大步(bu)，也為(wei)的科學家們(men)進(jin)壹(yi)步了解(jie)整(zheng)個(ge)人(ren)類基因組的功(gong)能，提(ti)供(gong)了非(fei)常(chang)寶貴的資(zi)源”，Taipale教(jiao)授說，“這項(xiang)成(cheng)果(guo)提(ti)高(gao)了我(wo)們(men)理(li)解(jie)基因組的能力，也有(you)助(zhu)於將(jiang)基因組信(xin)息應(ying)用到臨床上去(qu)。”