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總RNA提(ti)取(qu)可以:()獲(huo)得(de)高(gao)純(chun)度、高(gao)質量(liang)的(de)總RNA;(2)可以滿(man)足生物(wu)學(xue)下(xia)遊(you)實(shi)驗(yan)NorthernBlot、核(he)酸(suan)酶(mei)保護實(shi)驗(yan)、RT-PCR、qRT-PCR 和陣(zhen)列分析所(suo)需。
實(shi)驗(yan)方法(fa)原(yuan)理(li) 總RNA 提(ti)取(qu)試劑盒(he),可(ke)以用(yong)來制(zhi)備(bei)高(gao)質量(liang)的(de)可(ke)用(yong)於建(jian)庫(ku)的(de)RNA 。該總RNA 純(chun)化系統采用(yong)兩種(zhong)的(de)RNA酶(mei)抑(yi)制(zhi)劑(ji),異硫(liu)氰酸弧(hu)(GTC)和β-巰基乙醇,加(jia)上整個(ge)操作(zuo)都在(zai)冰(bing)浴(yu)下(xia)進(jin)行,這樣(yang)就(jiu)能顯(xian)著(zhu)降(jiang)低RNA 的(de)降(jiang)解速(su)率。
GTC和N-十(shi)二烷基肌(ji)氨(an)酸(suan)鈉(na)的(de)聯合(he)使(shi)用(yong),將促使(shi)核(he)蛋白(bai)復合(he)體(ti)的解離,使(shi)RNA 與(yu)蛋白(bai)質分離,並將RNA釋(shi)放(fang)到(dao)溶液(ye)中(zhong)。而(er)進(jin)壹步從復合(he)體(ti)中(zhong)純(chun)化RNA ,則根(gen)據(ju)Chomczynski和Sacchi的(de)壹步快速(su)抽(chou)提(ti)法(fa)進(jin)行,采用(yong)酸(suan)性酚-氯(lv)仿(fang)混合(he)液抽(chou)提(ti)。低(di)pH值的(de)酚將使(shi)RNA進(jin)入水(shui)相(xiang),這樣(yang)使(shi)其與仍留在(zai)有機(ji)相(xiang)中(zhong)的(de)蛋白(bai)質和DNA分離。水(shui)相(xiang)中(zhong)的(de)RNA 可用(yong)異丙(bing)醇沈(chen)澱(dian)濃(nong)縮。進(jin)壹步將上述RNA沈(chen)澱(dian)復(fu)溶(rong)於GTC溶(rong)液(ye)中(zhong),接(jie)著用(yong)異丙(bing)醇進(jin)行二次(ci)沈(chen)澱(dian),隨(sui)後用(yong)乙醇洗(xi)滌(di)沈澱(dian),即(ji)可(ke)去(qu)除(chu)所(suo)有(you)殘(can)留的蛋白(bai)質和無機鹽(yan),而(er)RNA 中(zhong)如(ru)含(han)無機鹽(yan),則有(you)可能對(dui)以後操作(zuo)中(zhong)的(de)壹些(xie)酶促反應產生抑(yi)制(zhi)。
實(shi)驗(yan)材料(liao) 微生物(wu) 動(dong)物(wu)細(xi)胞 植(zhi)物(wu)組(zu)織
試(shi)劑(ji)、試劑(ji)盒(he) RNA 提(ti)取(qu)試劑盒(he) 焦(jiao)碳(tan)酸(suan)二(er)乙酯 乙醇
儀器、耗材 恒溫水(shui)浴(yu) 冷凍(dong)高(gao)速(su)離心機 紫外分光(guang)光(guang)度(du)計(ji) 取液器 電(dian)泳儀 電(dian)泳槽
實(shi)驗(yan)步驟 壹(yi)、細(xi)胞或組(zu)織破(po)碎(sui)
. 微生物(wu)材料(liao)
()發(fa)酵(jiao)3-4天(tian)(或對(dui)數(shu)生)的(de)菌體(ti),離心收集菌絲體(ti)(動植(zhi)物(wu)材料(liao)無需此(ci)步處理(li))。
(2)用(yong)經(jing)DEPC處(chu)理(li)的水(shui)洗(xi)菌絲體(ti)2-3次(ci),並盡(jin)量(liang)除(chu)去(qu)殘存(cun)的(de)水(shui)。
(3)加(jia)液氮充分研磨,使(shi)其成為粉末(mo),以釋(shi)放(fang)RNA。
(4)研(yan)磨後的樣(yang)品(pin)轉(zhuan)移至(zhi)2 ml變性液的(de)容(rong)器中(zhong)勻漿。
2. 動植(zhi)物(wu)細(xi)胞培(pei)養(yang)材料(liao) (適(shi)用(yong)的(de)樣(yang)品(pin)量(liang)為細胞:08)
()細(xi)胞或組(zu)織培(pei)養(yang):按常(chang)規方法(fa)進(jin)行。
(2)深(shen)層懸浮(fu)培(pei)養(yang)細胞的(de)破(po)碎(sui)。
①細胞收(shou)集(ji):含(han)壹(yi)定(ding)濃(nong)度的(de)細(xi)胞培(pei)養(yang)液置於無菌離心管中(zhong),4℃,3 000 g離(li)心5分鐘。
②細(xi)胞洗(xi)滌(di):上步沈澱(dian)用(yong)25毫升(sheng)滅菌後冰(bing)凍(dong)的×PBS緩(huan)沖(chong)液洗(xi)滌(di),然後4℃,3 000 g離心5分鐘。
③細(xi)胞破(po)碎(sui):在(zai)沈澱(dian)細(xi)胞中(zhong)加(jia)入5 ml預(yu)冷的變性液,用(yong)無菌處理(li)過(guo)的勻漿器勻漿。
3. 表(biao)面培(pei)養(yang)細胞的(de)破(po)碎(sui)
()確(que)定培(pei)養(yang)瓶(ping)數(shu)量,使(shi)選(xuan)定的各(ge)培(pei)養(yang)瓶(ping)細(xi)胞累(lei)加(jia)後總量達08。
(2)細胞收(shou)集(ji):將培(pei)養(yang)液倒掉,用(yong)預(yu)冷(leng)的無菌PBS緩(huan)沖(chong)液洗(xi)滌(di)壹次(ci),在(zai)培(pei)養(yang)瓶(ping)中(zhong)加(jia)入8 ml預(yu)冷變性液,轉(zhuan)動培(pei)養(yang)瓶(ping),使(shi)細(xi)胞溶(rong)解,此時可(ke)見(jian)粘(zhan)度加(jia)大。
(3)用(yong)無菌吸管將*個培(pei)養(yang)瓶(ping)中(zhong)的(de)液體(ti)吸入第二個(ge)培(pei)養(yang)瓶(ping),旋(xuan)轉(zhuan),溶解細胞,再吸入第三(san)個培(pei)養(yang)瓶(ping),以此(ci)類(lei)推(tui),直(zhi)到(dao)將所(suo)選(xuan)定(ding)的培(pei)養(yang)瓶(ping)全部洗(xi)滌(di)壹次(ci),然(ran)後從*個培(pei)養(yang)瓶(ping)開(kai)始(shi)再加入4毫升(sheng)上述變(bian)性液,將所(suo)有(you)培(pei)養(yang)瓶(ping)洗(xi)壹(yi)次(ci)。
(4)將上述2 ml含(han)細(xi)胞的(de)變(bian)性液轉(zhuan)移至(zhi)壹50毫升(sheng)無菌離心管中(zhong),勻漿破(po)碎(sui)細胞。
3. 植(zhi)物(wu)組(zu)織破(po)碎(sui) (適用(yong)的(de)樣(yang)品(pin)量(liang)為0.05 g組(zu)織)
()將600 ul變性液置於.5 ml離(li)心管中(zhong),將此離(li)心管放於冰(bing)浴(yu)中(zhong)5分鐘。
(2)將0.05 g新鮮(xian)組(zu)織用(yong)液(ye)氮冰(bing)凍(dong)。
(3)在(zai)液氮下(xia),研(yan)磨組(zu)織塊(kuai)。
(4)待(dai)液(ye)氮揮發後,將上述分散的組(zu)織轉(zhuan)移至(zhi)無菌離心管中(zhong)。
4. 動(dong)物(wu)組(zu)織破(po)碎(sui) (適用(yong)的(de)樣(yang)品(pin)量(liang)為 g 組(zu)織)
()將2 ml變性液置於50 ml離(li)心管中(zhong),將此離(li)心管放於冰(bing)浴(yu)中(zhong)5分鐘。
(2)在(zai)上述管(guan)中(zhong)加(jia)入 g新(xin)鮮或冰(bing)凍(dong)動物(wu)組(zu)織,勻漿粉碎(sui)。
二、RNA 的(de)抽(chou)提(ti)
() 在(zai)經變(bian)性液勻漿的細(xi)胞或組(zu)織600 ul+60 ul pH4.0的(de)2 M 乙酸鈉*混(hun)勻,可用(yong)漩(xuan)渦(wo)振(zhen)蕩(dang)器。
(2)600 ul酚\氯仿(fang)\異戊醇(25\24\),*混(hun)勻或漩渦(wo)振(zhen)蕩(dang)器振(zhen)蕩(dang)0秒(miao)。
(3)冰(bing)裕中(zhong)0-5分鐘,離(li)心,4℃,0 000 g,20分鐘。
(4)上層水(shui)相(xiang)吸至無菌離心管中(zhong)+等(deng)體(ti)積(ji)的異丙(bing)醇,-70℃,30分鐘沈(chen)澱(dian)RNA。
(5)離(li)心4℃,0 000g,20分鐘。
(6)沈(chen)澱(dian)RNA ,冷(leng)凍(dong)幹燥5分鐘 , RNA 沈(chen)澱(dian)重新(xin)溶(rong)於300 ul變(bian)性液中(zhong),可(ke)振(zhen)蕩(dang)(有(you)時為了幫助(zhu)溶(rong)解,可在(zai)65℃加熱(re),但(dan)時間(jian)應極(ji)短(duan))。
(7) 60 ul pH4.0的2M乙酸鈉*混(hun)勻,可用(yong)漩(xuan)渦(wo)振(zhen)蕩(dang)器。
(8) 600 ul酚\氯仿(fang)\異戊醇(25\24\),*混(hun)勻或漩渦(wo)振(zhen)蕩(dang)器振(zhen)蕩(dang)0秒(miao)。
(9) 冰(bing)裕中(zhong)0-5分鐘,離(li)心,4℃,0 000 g,20分鐘。
(0)上層水(shui)相(xiang)吸至無菌離心管中(zhong)。
() 等(deng)體(ti)積(ji)異丙(bing)醇二(er)次(ci)沈(chen)澱(dian)(-70℃,30分鐘),75%乙醇洗(xi)沈(chen)澱(dian),沈(chen)澱(dian)冷(leng)凍(dong)幹燥,復(fu)溶於去(qu)RNA 酶的水(shui)中(zhong)(對(dui)於準(zhun)備保存(cun)的(de)RNA 可加入pH 5.0的(de)乙酸鈉至(zhi)終(zhong)濃(nong)度為0.25 M,再加入2.5體(ti)積(ji)的乙醇,-70℃保存(cun)。)。
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