78個(ge)細菌(jun)基因組(zu)的(de)Z初分(fen)析(xi)

    美(mei)國(guo)國(guo)立(li)衛(wei)生研(yan)究院人類(lei)微生物（Human Microbiome Jumpstart Reference Strains Consortium）旗(qi)下(xia)的(de)人類(lei)微生物Jumpstart代(dai)表菌(jun)株聯(lian)盟（Human Microbiome Jumpstart Reference Strains Consortium）的(de)研(yan)究人員公布了微生物基(ji)因組(zu)測(ce)序計(ji)劃(hua)中的(de)頭78個(ge)與(yu)人類(lei)宿(xiu)主有關(guan)的(de)細菌(jun)基因組(zu)序列的(de)zui初的(de)分(fen)析(xi)。ELISA試(shi)劑盒(he)

    由(you)於二十(shi)世(shi)紀90年代(dai)啟(qi)動的(de)人類(lei)基(ji)因組(zu)計(ji)劃(hua)（HGP）以當(dang)時的(de)技術水平(ping)要(yao)在5年內(nei)完(wan)成(cheng)這(zhe)壹(yi)計(ji)劃(hua)任(ren)務(wu)是很(hen)艱(jian)巨的(de)。為了順利(li)完(wan)成(cheng)人類(lei)基(ji)因組(zu)特別(bie)是功(gong)能基(ji)因組(zu)計(ji)劃(hua)，科學(xue)家(jia)們(men)同時也啟(qi)動了模(mo)式生物基(ji)因組(zu)計(ji)劃(hua)，以期探(tan)討序列測(ce)定(ding)的(de)新技術新方法(fa)以及(ji)確(que)定(ding)基因功(gong)能的(de)表達(da)模(mo)式，其中包(bao)括大腸(chang)埃(ai)希(xi)菌(jun)、流感(gan)嗜(shi)血桿(gan)菌(jun)、釀(niang)酒(jiu)酵(jiao)母等(deng)微生物。

    在(zai)過(guo)去的(de)0年中(zhong)，微生物學(xue)領(ling)域得到巨大的(de)轉變(bian)，這部分(fen)是由(you)於坐落在(zai)馬裏蘭州洛克菲勒市的(de)基因組(zu)研(yan)究所（TIGR）的(de)基因組(zu)測(ce)序儀的(de)幫(bang)助。TIGR的(de)科學(xue)家(jia)們(men)發表了zui初(chu)三(san)個(ge)完(wan)整(zheng)的(de)微生物基(ji)因組(zu)序列——Haemppholus influenzae, Mycoplasma genitalium與(yu)Methanococcus jannaschii，並且(qie)隨(sui)後(hou)完(wan)成(cheng)了至2004年(nian)月份(fen)完(wan)成(cheng)與(yu)發(fa)表的(de)50個(ge)微生物基(ji)因組(zu)中的(de)40個(ge)。ELISA試(shi)劑盒(he)

    研(yan)究人員將與(yu)其他人共(gong)享(xiang)他們(men)的(de)數(shu)據(ju)，這(zhe)樣(yang)其他的(de)遺傳學(xue)家(jia)如果(guo)試(shi)圖從(cong)自(zi)然(ran)環境(jing)中對大量的(de)微生物基(ji)因組(zu)做(zuo)直接(jie)采樣的(de)話，他們(men)可以參考這些數(shu)據(ju)。這(zhe)壹(yi)對(dui)我(wo)們(men)身體上的(de)微生物的(de)更好(hao)的(de)理解會在將來對(dui)了解某些人類(lei)的(de)疾(ji)病(bing)提(ti)供(gong)線(xian)索。

    研(yan)究人員了對(dui)在(zai)其自然(ran)環境(jing)中的(de)微生物進行大(da)規模(mo)基因組(zu)測(ce)序的(de)標準(zhun)化(hua)方法(fa)，他們(men)的(de)目(mu)標之壹(yi)是為(wei)至少(shao)900種(zhong)將人體(ti)稱為(wei)住(zhu)所(suo)的(de)細菌(jun)制作(zuo)出參照基因組(zu)序列。目(mu)前公(gong)開(kai)的(de)是頭78個(ge)與(yu)人類(lei)宿(xiu)主有關(guan)的(de)細菌(jun)基因組(zu)序列的(de)zui初的(de)分(fen)析(xi)。 到目(mu)前為(wei)止(zhi)，這些結果(guo)給未來的(de)分(fen)析(xi)工作(zuo)提(ti)供(gong)了壹(yi)個(ge)重要的(de)基線(xian)，盡管(guan)這些研(yan)究人員說(shuo)，他們(men)只是剛(gang)剛(gang)觸及(ji)了人類(lei)“微生物組(zu)"的(de)表面(mian)而(er)已。

    機(ji)體除(chu)受自身(shen)基(ji)因的(de)調(tiao)控(kong)外(wai)，還受到大量的(de)共生細菌(jun)的(de)影響(xiang)。這(zhe)些細菌(jun)大部分(fen)寄(ji)生在(zai)人的(de)腸道(dao)中，通(tong)稱為(wei)腸(chang)道(dao)菌(jun)群，在(zai)學(xue)術界常被稱作(zuo)“人體(ti)腸(chang)道元基(ji)因組(zu)"。該(gai)項研(yan)究成果(guo)收(shou)集(ji)了24個(ge)來自(zi)於歐洲(zhou)人腸(chang)道(dao)菌(jun)群的(de)樣本，采用(yong)了新(xin)壹(yi)代(dai)大規模(mo)高通(tong)量的(de)測(ce)序技術進行深度測(ce)序，產出(chu)近(jin)6千億的(de)堿基序列。經(jing)過序列組(zu)裝(zhuang)和(he)基因註(zhu)釋(shi)分(fen)析(xi)，從(cong)中(zhong)獲得330萬個(ge)非冗(rong)余的(de)人體(ti)腸(chang)道元基(ji)因組(zu)的(de)參考基因，約(yue)是人自(zi)身(shen)基因的(de)50倍。這(zhe)個(ge)基(ji)因集(ji)中(zhong)包含(han)了絕(jue)大部分(fen)目(mu)前已知的(de)人體(ti)腸(chang)道微生物基(ji)因，但(dan)更多的(de)是目(mu)前未知微生物的(de)基因。從(cong)這(zhe)個(ge)基(ji)因集(ji)中(zhong)可以估(gu)計(ji)人腸(chang)道(dao)中存在(zai)約000到50種細菌(jun)，平均每(mei)個(ge)體(ti)內(nei)約(yue)含(han)有60種優勢菌(jun)種，並且(qie)這(zhe)些細菌(jun)是絕(jue)大部分(fen)個(ge)體(ti)所共有的(de)。ELISA試(shi)劑盒(he)

    人體(ti)微生物的(de)研(yan)究可能成(cheng)為(wei)科學(xue)家(jia)們(men)的(de)新熱(re)點課(ke)題，時間(jian)過去3年(nian)，這壹(yi)預(yu)測(ce)就(jiu)得到實現，隨著(zhe)腸道微生物基(ji)因組(zu)計(ji)劃(hua)，腸道(dao)微生物與(yu)代(dai)謝疾(ji)病(bing)的(de)研(yan)究步伐的(de)加速(su)，腸道(dao)微生物研(yan)究受到的(de)重視(shi)。